www เป็น subdomain ของเว็บหลัก
Google จะเห็น www.yoursite.com กับ yoursite.com ไม่เหมือนกัน

backlink ที่ยิงไปที่ www.yoursite.com ก็ไม่ถือว่ายิงไปที่ yoursite.com

วิธีแก้ให้ไปเลือก preferred domain ใน google webmaster tool
หากเราเลือก เป็น www.yoursite.com google ก็จะแสดงผลใน search result เป็น www.yoursite.com ให้
และ backlink ทั้งหมด ที่ยิงไปที่ www.yoursite.com และ yoursite.com ก็จะเทไปที่ www.yoursite.com ที่เดียว

ปัญหาที่สำคัญของ webmaster tool คือถ้าเราเอาเว็บไปฝาก webmaster tool หมด ก็จะโดน google ล้วงตับ
ถ้ามีเว็บผิดกฎถูกแบน เว็บอื่นจะโดนเพ่งเล็งไปด้วย

วิธีแก้อีกวิธีหนึ่งก็คือ เวลาหา backlink ให้ยิงไปที่ www.yoursite.com ทั้งหมด ห้ามยิงไปที่ yoursite.com
ทีนี้ google ก็จะเห็นว่า www.yoursite.com เป็นเว็บที่มีความสำคัญกว่า และถูกนำมาแสดงผลใน search engine เอง